腾冲雪鸡mtDNA D-loop区遗传多样性分析

• 作者: 王荣琼 张自芳 黄静 钱林东 滕晓红 苗永旺
• 来源期刊: 云南农业大学学报（自然科学）
• 关键词: 腾冲雪鸡 mtDNA D-loop 遗传多样性 母系世系 遗传分化
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 动物科学|Animal Science
• 页码范围: 75-81
• 页数: 7页
• 分类号: S831.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.12101/j.issn.1004-390X(n).201908052

摘要

[目的]阐明腾冲雪鸡群体遗传背景信息.[方法]采用PCR产物直接测序技术对144只腾冲雪鸡样品的mtDNA D-loop区序列变异进行检测,在此基础上结合已发表的云南其他地方鸡数据进行群体遗传学分析.[结果]在所检测的腾冲雪鸡序列中,碱基T、C、A和G平均含量分别为30.2％、29.8％、27.3％和12.6％,序列A+T平均含量为57.6％;共检测到33个核苷酸多态位点,占检测核苷酸位点总数的6.35％,其中4个为单一信息位点,29个为简约信息位点,数据突变形式主要为转换.在该群体中共发现21种单倍型,单倍型多样度(H)为0.890±0.011,核苷酸多样度(r值)为0.01641±0.00028,序列间平均核苷酸差异数和整个群体平均遗传多样性分别为8.534和0.017±0.004.系统发育分析显示:腾冲雪鸡包含A、B、E、F和G5个母系世系,各世系所占的比例分别为25.00％、20.83％、15.28％、30.56％和8.33％.[结论]揭示腾冲雪鸡遗传多样性丰富,在世系组成比例上有别于云南其他地方鸡,且与它们有一定遗传分化.