基于GEO数据库的IgA肾病基因的筛选和生物信息学分析

• 作者: 刘音 赵彬 谢裕赛 杨涛
• 来源期刊: 临床肾脏病杂志
• 关键词: GEO数据库 生物信息学 IgA肾病 差异表达基因 枢纽基因
• 年，卷（期）: 2021,（3）
• 所属期刊栏目: 临床研究|CLINICAL STUDY
• 页码范围: 194-198
• 页数: 5页
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1671-2390.m20-132

摘要

目的 通过生物信息学分析鉴定IgA肾病的生物标志物,旨在阐明IgA肾病疾病进展的可能分子机制.方法 从GEO数据库下载包含IgA肾病患者和健康对照的微阵列数据集GSE104948、GSE93798和GSE37460数据集,并使用limma R包进行分析,以获得差异表达基因.然后进行GO分析和KEGG通路富集分析,运用STRING和Cytoscape软件构建蛋白互作网络以阐明IgA肾病的分子机制.结果 应用limma R包分析鉴定出30个DEG,包括16个上调基因,14个下调基因.FN1和COL1A2等上调基因主要参与细胞外基质受体互作及PI3K-Akt信号通路.IgA肾病中ALB基因显著下调.FN1,COL1A2,ALB和FABP1基因被筛选为枢纽基因.结论 FN1、COL1A2、ALB和FABP基因可能在IgA肾病的发展中起重要作用,并可能作为诊断和治疗IgA肾病的潜在分子靶标.