高温胁迫下玉米钙依赖蛋白激酶基因的表达及功能

• 作者: 张宇萍 杨少玉 胡秀丽 杨浩
• 来源期刊: 河南农业大学学报
• 关键词: 玉米 钙依赖蛋白激酶 高温胁迫 生物信息学
• 年，卷（期）: 2021,（2）
• 所属期刊栏目: 作物科学|Crop Science
• 页码范围: 227-233,256
• 页数: 8页
• 分类号: S513
• 语种: 中文

摘要

利用多种生物信息学手段从玉米基因组鉴定CDPKs家族基因,并从染色体定位、表达水平、功能聚类、功能预测分析及利用实时荧光定量PCR方法分析高温胁迫下该家族基因的表达水平.结果表明,ZmCDPKs包含32个家族成员,分布在9条染色体上,相对分子质量13.6～62.9 kD,将玉米、拟南芥和水稻序列比对分析,得出形成了4个明显的分支的结论,暗示着它们在功能上存在着差异.从ZmCDPKs家族中筛选出ZmCDPK6基因响应高温胁迫,通过RNA-seq数据分析,推测ZmCDPK6在果皮和胚根中高度表达,并且还受到盐胁迫和低温胁迫诱导表达.