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基于RNA-Seq分析MpigE在红曲霉色素生物合成中的转录调控
基于RNA-Seq分析MpigE在红曲霉色素生物合成中的转录调控
作者:
倪峰
丁允章
马静静
王嘉琦
蒋冬花
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
红曲霉
红曲色素
基因缺失
代谢调控
摘要:
[目的]分析MpigE的缺失在转录水平对红曲色素产生的影响.[方法]对实验室保存的野生型紫色红曲霉(Monascus purpureus) Mp-21和△MpigE菌株进行高通量转录组测序、注释、表达差异基因功能富集分析和基因通路富集分析,在转录水平揭示MpigE缺失后红曲霉色素产量变化的原因.[结果]通过RNA-Seq测序,每个样品获得7.5-8.5 Gb的原始数据,经过拼接后得到7219个转录本(Unigenes),其中成功注释的为5692个.差异基因表达富集分析发现基因缺失菌株△MpigE相较于野生型菌株Mp-21上调差异基因达到199个,下调差异基因为293个.[结论]MpigE的缺失能够促进红曲霉中中央碳代谢和乙酰辅酶A代谢相关基因的表达以此影响色素生物合成.
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基于RNA-Seq分析MpigE在红曲霉色素生物合成中的转录调控
来源期刊
微生物学报
学科
关键词
红曲霉
红曲色素
基因缺失
代谢调控
年,卷(期)
2021,(3)
所属期刊栏目
研究报告|RESEARCH ARTICLES
研究方向
页码范围
695-706
页数
12页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.13343/j.cnki.wsxb.20200339
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研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
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期刊影响力
微生物学报
主办单位:
中国科学院微生物研究所
中国微生物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
0001-6209
CN:
11-1995/Q
开本:
大16开
出版地:
北京朝阳区北辰西路1号中科院微生物所内
邮发代号:
2-504
创刊时间:
1953
语种:
chi
出版文献量(篇)
4459
总下载数(次)
15
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