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滇龙胆GrHDR基因的克隆与表达分析
滇龙胆GrHDR基因的克隆与表达分析
作者:
杜波
蔡传涛
张霁
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
滇龙胆
GrHDR基因
序列分析
组织表达分析
龙胆苦苷
摘要:
龙胆苦苷(gentiopicroside)是中药龙胆中的主要药效成分,属于萜类化合物的衍生物.1-羟基-2-甲基-2-(E)-丁烯基-4-二磷酸还原酶[1-hydroxy-2-methyl-2-(E)-butenyl-4-diphosphate reductase,HDR]是萜类物质合成途径中的关键酶.为探讨不同光照条件下滇龙胆HDR(GrHDR)基因的表达与龙胆苦苷含量之间的关系,该文以滇龙胆叶片cDNA为模板,采用PCR和TA克隆技术获得GrHDR基因序列,对该序列进行生物信息学分析和表达分析,并采用高效液相色谱法测定龙胆苦苷含量,对该基因表达与龙胆苦苷含量进行比较.结果表明:(1)GrHDR基因(GenBank登录号:KJ917165.1)全长1398 bp,编码465个氨基酸,推定GrHDR蛋白是亲水且稳定的,相对分子质量是52281.25 Da,理论等电点是5.32;(2)该蛋白属于LYTB蛋白家族,可能定位于叶绿体上,无信号肽,二级结构主要由 α-螺旋(45.16%)、β-转角(6.24%)、无规卷曲(33.98%)、延伸链(14.62%)构成;(3)GrHDR蛋白序列与同属植物秦艽的HDR蛋白相似性最高(95.71%);(4)实时荧光定量PCR结果显示GrHDR基因在滇龙胆中的表达量为根>叶>茎,而在10%、30%、100%全光光照条件下各组织的表达量有很大差异;(5)高效液相色谱法结果显示,不同光照条件下龙胆苦苷含量一致,均为根>叶>茎,其中100%全光光照下,药用部位根中龙胆苦苷含量达到7.141%,约是30%、10%全光光照条件的两倍,但该结果与同一光照条件下GrHDR基因表达规律不完全一致.该研究为阐述HDR基因功能及其与龙胆苦苷含量的关系提供参考.
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篇名
滇龙胆GrHDR基因的克隆与表达分析
来源期刊
广西植物
学科
关键词
滇龙胆
GrHDR基因
序列分析
组织表达分析
龙胆苦苷
年,卷(期)
2021,(6)
所属期刊栏目
生理与分子生物学|Physiology and Molecular Biology
研究方向
页码范围
1004-1013
页数
10页
分类号
Q943
字数
语种
中文
DOI
10.11931/guihaia.gxzw201912007
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研究来源
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期刊影响力
广西植物
主办单位:
广西壮族自治区广西植物研究所
中国科学院广西植物研究所
广西植物学会
出版周期:
月刊
ISSN:
1000-3142
CN:
45-1134/Q
开本:
大16开
出版地:
广西桂林市雁山镇85号广西植物研究所《广西植物》编辑部
邮发代号:
48-43
创刊时间:
1981
语种:
chi
出版文献量(篇)
3580
总下载数(次)
1
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