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老鸦瓣实时定量PCR内参基因的筛选和验证
老鸦瓣实时定量PCR内参基因的筛选和验证
作者:
徐碧霞
郭巧生
朱再标
张军霞
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
老鸦瓣
内参基因
表达稳定性
GBSS基因
摘要:
药用植物老鸦瓣供需矛盾日益凸显,但分子生物学方面研究基础还较薄弱.为开展老鸦瓣相关功能基因表达量的分析检测,需要选择适宜的内参基因以提高实验结果准确性.从老鸦瓣转录组数据中筛选出8个候选内参基因(ACT,TUA,CYP,GAPDH,UBQ,UBI,EF1α,UBC),利用实时荧光定量技术检测候选内参基因在老鸦瓣鳞茎、叶、花以及芽茎不同发育阶段中的表达水平.应用GeNorm,NormFinder和BestKeeper软件以及RefFinder网站综合评估内参基因稳定性.结果 表明8个候选内参基因中UBC的Ct变化范围最小,表达水平最稳定,适合作为内参基因;GeNorm和NormFinder软件分析结果显示UBC和UBI的稳定性相对较好;BestKeeper评估CYP和UBC表达较稳定;RefFinder网站综合排序稳定性最好的基因为UBC和UBI,而ACT在所有软件评估中稳定性最差.分别以稳定性最好的UBC,UBI和最差的ACT为内参基因检测老鸦瓣GBSS基因的表达,GBSS基因在UBC和UBI校正下表达模式相同,以ACT为内参时表达趋势有较大差异,进一步验证了筛选结果的可靠性,表明UBC和UBI均适合作为老鸦瓣不同器官和芽茎不同发育时期基因表达研究的内参基因.该研究筛选得到的稳定内参基因UBC和UBI为后续开展老鸦瓣中关键基因表达分析研究奠定了基础.
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篇名
老鸦瓣实时定量PCR内参基因的筛选和验证
来源期刊
中国中药杂志
学科
关键词
老鸦瓣
内参基因
表达稳定性
GBSS基因
年,卷(期)
2021,(4)
所属期刊栏目
分子生药学
研究方向
页码范围
938-943
页数
6页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.19540/j.cnki.cjcmm.20201120.104
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内参基因
表达稳定性
GBSS基因
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国中药杂志
主办单位:
中国药学会
出版周期:
半月刊
ISSN:
1001-5302
CN:
11-2272/R
开本:
大16开
出版地:
北京市东直门内南小街16号
邮发代号:
2-45
创刊时间:
1955
语种:
chi
出版文献量(篇)
15538
总下载数(次)
36
总被引数(次)
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