柯萨奇病毒B4型VP蛋白的生物信息学分析

• 作者: 陈泳蓓 陆俏岑 何韵怡 陈柏希 吴岳 刘洪波
• 来源期刊: 华夏医学
• 关键词: 柯萨奇病毒B组4型 VP1蛋白 生物信息学 B细胞表位
• 年，卷（期）: 2021,（1）
• 所属期刊栏目: 论著|ORIGINAL ARTICLES
• 页码范围: 21-25
• 页数: 5页
• 分类号: R373.23
• 语种: 中文
• DOI: 10.19296/j.cnki.1008-2409.2021-01-006

摘要

目的:分析柯萨奇病毒B4型(coxsackievirus B4,CVB4)的结构蛋白VP1的分子结构,预测其生物学信息.方法:应用Bioedit、DNAstar、ABCpred软件,以及免疫表位数据库网站IEDB和生物信息学门户ExPASy提供的多种在线工具,对CVB4 VP1蛋白的氨基酸序列进行分析.结果:CVB4 VP1蛋白的等电点8.31,相对分子量32.1 kD,为亲水性、不稳定蛋白质;有36个可能的磷酸化位点,无信号肽和跨膜螺旋结构,二级结构以无规则卷曲为主;预测有5条优势线性B细胞表位.结论:通过对CVB4 VP1蛋白的生物信息学分析,得到了VP1蛋白的理化性质,相关结构的功能特征及线性B细胞表位等生物信息资料.