柯萨奇病毒A6型VP1蛋白的生物信息学分析

• 作者: 刘洪波 欧维琳 沈关心 阳广菲
• 来源期刊: 中国免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 柯萨奇病毒A组6型 VP1蛋白 生物学信息 B细胞表位 理化性质
• 年，卷（期）: 2016,（4）
• 所属期刊栏目: 免疫学技术与方法
• 页码范围: 536-541
• 页数: 6页
• 分类号: R373.2+3
• 字数: 3796字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-484X.2016.04.019

摘要

目的：预测柯萨奇病毒A组6型（ Coxsackievirus A6，CVA6）的衣壳蛋白VP1的基本理化性质、结构功能及线性B细胞表位。方法：应用Bioedit软件、SubLoc、TargetP和生物信息学资源门户ExPASy中的多种在线工具对CVA6 VP1的氨基酸序列进行分析。结果：CVA6 VP1为一亲水性蛋白，其相对分子量为33.6 kD，等电点为7.92，含有24个可能的磷酸化位点，没有信号肽、跨膜区和可能的脂酰化位点；其二级结构中以无规则卷曲居多，有48.52％的氨基酸残基暴露于溶液界面；该分子内存在多个潜在的线性B细胞表位，其中的155～165位氨基酸残基区域的抗原指数最高。结论：成功预测到CVA6 VP1的基本理化性质、结构功能特征及可能的线性B细胞表位，为该蛋白的进一步研究及疫苗和免疫诊断试剂的研制打下基础。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	沈关心	华中科技大学同济医学院免疫学系	114	554	12.0	18.0
2	欧维琳	桂林医学院附属医院儿科	77	336	10.0	13.0
3	刘洪波	桂林医学院第二附属医院检验科	11	17	2.0	4.0