CDK1基因在肺动脉高压中表达和临床意义的生物信息学分析

• 作者: 秦雨晗 乔勇 鄢高亮 王栋 汤成春
• 来源期刊: 临床心血管病杂志
• 关键词: CDK1 关键基因 肺动脉高压 生物信息学 GEO
• 年，卷（期）: 2021,（7）
• 所属期刊栏目: 肺动脉高压|Pulmonary Hypertension
• 页码范围: 651-658
• 页数: 8页
• 分类号: R541.5
• 语种: 中文
• DOI: 10.13201/j.issn.1001-1439.2021.07.012

摘要

目的:通过生物信息学的方法分析筛选肺动脉高压(PAH)的关键基因.方法:通过GEO数据库下载GSE113439和GSE144274.依次进行GO、KEGG及GSEA进行功能及通路富集分析.利用String及Cyto-scape软件建立蛋白互作(PPI)网络,进一步通过MCODE、CentiScape和CytoHubba插件筛选核心基因.结果:GSE113439中有544个DEGs(上调462个,下调82个),主要参与DNA双链解螺旋、DNA修复、有丝分裂核分裂等生物学过程.GSE144274中有1121个DEGs(上调702个,下调509个),主要参与细胞分裂、有丝分裂姐妹染色单体分离、染色体分离等生物学过程.两组数据集的DEGs均显著富集在细胞周期信号通路.建立PPI网络后,根据MCODE和CentiScape插件筛选出关键作用模块,根据MCC算法选择关键候选基因,并最终筛选出CDK1为关键基因.结论:CDK1是PAH的关键基因,可能成为PAH潜在的治疗靶点.