龙眼TCP家族全基因组鉴定与表达分析

• 作者: 蒋梦琦 薛晓东 苏立遥 陈燕 张舒婷 李晓斐 王培育 张梓浩 赖钟雄 林玉玲
• 来源期刊: 园艺学报
• 学科: 农学
• 关键词: 龙眼 TCP转录因子 成员鉴定 ABA MeJA 实时荧光定量PCR
• 年，卷（期）: 2021,（12）
• 所属期刊栏目: 研究报告|Research Notes
• 页码范围: 2481-2496
• 页数: 16页
• 分类号: S667.2
• 语种: 中文
• DOI: 10.16420/j.issn.0513-353x.2020-0717

摘要

利用生物信息学方法对龙眼TCP (DlTCP)基因家族进行全基因组鉴定,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术分析龙眼TCP基因家族成员体胚发生早期表达模式及其对ABA和MeJA的响应模式.从龙眼基因组数据库中共鉴定获得20个龙眼TCP成员.这些DlTCP蛋白包含169～540个不等的氨基酸残基,分子量介于39.6～57.2 kD之间,理论等电点介于5.90 ～ 9.45.亚细胞定位预测显示,18个成员在细胞核中.染色体定位显示,DlTCP分布在龙眼15条染色体中的11条染色体上;共线性分析发现有12个DlTCP基因参与片段复制事件.启动子顺式作用元件分析显示,DlTCP成员启动子序列上含有响应激素应答、调控生长发育的元件.系统进化分析可将DlTCP分为2类,均具有典型TCP结构域.体胚发生早期表达模式分析表明,DlTCP2/4a/4b/13/17/18/19/23均在胚性愈伤组织阶段高表达,DlTCP5b/DlTCP8在不完全胚性紧实结构阶段表达量较高,DlTCP20a在球形胚阶段高表达,表明DlTCP在体胚发生早期阶段的优先表达可能有助于该阶段的形态建成.经外源ABA诱导后4个DlTCP成员表达量显著下调,4个上调;MeJA诱导后,3个成员表达量显著下调,4个上调,说明DlTCP成员可以响应ABA和MeJA.