生物信息学在筛选影响结直肠癌预后基因中的应用

• 作者: 伏小红 冯宦翔 苟伟 杨敏 郭靓 屈春燕
• 来源期刊: 国际检验医学杂志
• 关键词: 结直肠癌 差异表达基因 生物标记物基因
• 年，卷（期）: 2021,（10）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1184-1188
• 页数: 5页
• 分类号: R735.3+5|R446.9
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1673-4130.2021.10.008

摘要

目的 拟用生物信息学方法,筛查出影响结直肠癌(CRC)预后的相关基因,为寻找CRC早期诊断标志物提供指导.方法 用生物信息学手段,对正常结直肠和C RC组织进行对比分析,筛选出差异表达基因(DEGs).结果 共检测到62个DEGs,分析发现下调的DEGs在肾素和胰腺分泌调节信号通路富集,相关基因为CLCA1和CLCA4,而上调的DEGs未见明显的信号通路.对其中6个下调基因进行分析,发现6个下调基因中有2个对结肠腺癌预后有明显影响,通过富集分析发现,CLCA4在肾素分泌通路中表达明显降低.结论 CLCA1和CLCA4在CRC中表达明显降低,有可能成为CRC的潜在诊断标志物和治疗靶点.