基于生物信息学分析HLA-DMA基因在LGG中的表达和功能

• 作者: 李泽艳 王晓旋 来明名 马雪艳
• 来源期刊: 医学信息
• 学科: 医学
• 关键词: LGG HLA-DMA 免疫调节
• 年，卷（期）: 2021,（24）
• 所属期刊栏目: 论著|Treatise
• 页码范围: 21-26
• 页数: 6页
• 分类号: R739.41
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-1959.2021.24.005

摘要

目的 基于生物信息学方法探讨H LA-DMA基因在低级别脑胶质瘤(LGG)中的表达和功能.方法 基于GEPIA数据库分析HLA-DMA在LGG和正常组织中的表达差异;从TCGA数据库中下载正常组织和LGG组织基因表达数据和临床资料,采用R软件分析H LA-DMA表达水平与临床病理特征和预后的关系;利用Coexpedia构建HLA-DMA在LGG中的共表达基因网络,并用FunRich软件对共表达基因进行注释;借助GSEA探讨HLA-DMA参与的信号通路.结果 LGG组织中HLA-DMA表达高于正常组织,差异有统计学意义(P＜0.05),且与肿瘤分级和预后相关;单、多因素Cox分析显示,HLA-DMA可作为LGG患者的独立预后因素(P＜0.05);HLA-DMA与共表达基因所参与的分子生物学功能主要与免疫调节相关;GSEA结果显示,HLA-DMA高表达主要富集于免疫调节相关通路和凋亡通路.结论 HLA-DMA在LGG中呈高表达,可作为LGG治疗和预后评估的潜在靶点.