冬青卫矛LTR反转录转座子RT序列克隆及分析

• 作者: 贺诗琪 范付华 吴宇航 龙蓉 王君荣 陈美吉
• 来源期刊: 山地农业生物学报
• 学科: 农学
• 关键词: 冬青卫矛 LTR反转录转座子 反转录酶 异质性
• 年，卷（期）: 2022,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 1-6,27
• 页数: 7页
• 分类号: S718.3
• 语种: 中文
• DOI: 10.15958/j.cnki.sdnyswxb.2022.03.001

摘要

本文以冬青卫矛基因组DNA为模板,克隆LTR反转录转座子Ty1-copia类与Ty3-gypsy类反转录酶(re-verse transcriptase,RT)序列,通过测序及相关生物信息学软件对所获序列变化特点进行分析.最终获得Ty1-copia与Ty3-gypsy类反转录转座子RT序列分别为40条和39条.其中Ty1-copia-RT序列长度在231～267 bp之间,核酸序列的相似性为8.05％～97.7％;Ty3-gypsy-RT序列长度范围为365～499 bp,核酸序列的相似性为10.04％～99.31％.将所获得的核酸序列翻译为氨基酸后发现RT氨基酸序列具有高度异质性.通过与其他物种RT序列进行比对,结果显示冬青卫矛与其他一些植物间的部分RT序列相似性较高,可能存在共同起源,印证了 LTR反转录转座子不同物种间可能存在横向传递.