天人菊matK基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 徐丽娟 熊勇
• 来源期刊: 云南民族大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 天人菊 matK基因 生物信息学 基因表达
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 所属期刊栏目: 民族药资源
• 页码范围: 24-34
• 页数: 11页
• 分类号: Q7
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-8513.2022.01.004

摘要

为了完善天人菊的遗传信息,丰富菊科植物分子生物学分析数据.通过PCR扩增、基因克隆获得天人菊matK基因的完整核苷酸序列,采用生物信息学方法分析天人菊matK蛋白的结构及性质,并与其他12种matK氨基酸序列进行对比,构建系统进化树.结果表明,天人菊matK基因全长1296 bp,可编码432个氨基酸,二级结构以α-螺旋为主,无跨膜结构,无信号肽,是不稳定亲水性蛋白,存在于叶绿体中,matK氨基酸序列在不同的生物种类中具有高度的保守性.天人菊matK蛋白与遗传距离较近的菊科植物蛋白相比仅有15处氨基酸变异位点,而与遗传距离较远的加州玫瑰和北美黑莓对比存在138处氨基酸变异位点,且基因的5'端氨基酸变异频率低于3'端.基因本体论分析可知matK蛋白在13种不同的生物中可靠度为60％ ～70％,具有多种分子功能,并参与了众多的生物学过程.对天人菊matK基因进行了深入的分析,为天人菊的进一步研究提供了理论依据.