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斑马鱼Hepcidin-2基因结构的生物信息学分析与抗菌活性优化设计
斑马鱼Hepcidin-2基因结构的生物信息学分析与抗菌活性优化设计
作者:
胡媛媛
刘子琦
乔子祺
陈欣
尹华雯
姚波
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
Hepcidin
斑马鱼
基因结构
生物信息学
抗菌活性
优化设计
摘要:
目的 对斑马鱼Hepcidin-2基因结构进行生物信息学分析,并设计优化其抗菌活性.方法 选取斑马鱼Hepcidin-2作为目的基因,通过Tblastn进行多序列同源性比对得到Hepcidin基因家族的核苷酸和氨基酸序列,利用生物信息学方法分析其进化关系、理化性质、信号肽、跨膜结构、二级结构、三级结构等;收集和筛选多个物种的Hepcidin序列152条,计算成熟肽各个位置最大频率的氨基酸,得到序列模板,并对序列模板进行预测.结果 抗菌肽(antimicrobial peptide,AMP)活性中心空间结构高度保守,C-末端及信号肽区域形成跨膜螺旋结构,成熟肽部分存在β-折叠,得到的序列模板预测具有抗真菌活性,对肺炎克雷伯菌有抗菌活性,对人红细胞有溶血活性.结论 建立了序列模板法优化AMP序列和预测其抗菌活性的技术路线,为改造天然AMP,扩大其在临床和生产中的应用提供了理论支持和技术支撑.
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文献信息
篇名
斑马鱼Hepcidin-2基因结构的生物信息学分析与抗菌活性优化设计
来源期刊
中国生物制品学杂志
学科
生物学
关键词
Hepcidin
斑马鱼
基因结构
生物信息学
抗菌活性
优化设计
年,卷(期)
2022,(2)
所属期刊栏目
基础研究
研究方向
页码范围
150-158
页数
9页
分类号
Q784
字数
语种
中文
DOI
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斑马鱼
基因结构
生物信息学
抗菌活性
优化设计
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国生物制品学杂志
主办单位:
中华预防医学会
长春生物制品研究所有限责任公司
出版周期:
月刊
ISSN:
1004-5503
CN:
22-1197/Q
开本:
大16开
出版地:
长春市西安大路3456号
邮发代号:
12-128
创刊时间:
1988
语种:
chi
出版文献量(篇)
5980
总下载数(次)
27
总被引数(次)
20856
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