丽江猪MAPK10基因编码区分离、序列分子特征及组织差异表达分析

• 作者: 兰国湘 金思琪 严达伟 鲁绍雄 崔艺佳 李国美 李海莲 董新星
• 来源期刊: 云南农业大学学报（自然科学）
• 学科: 农学
• 关键词: 丽江猪 MAPK10基因 生物信息学分析 组织表达 脂肪沉积
• 年，卷（期）: 2022,（1）
• 页码范围: 82-90
• 页数: 9页
• 分类号: S828.9+2
• 语种: 中文

摘要

[目的]分离丽江猪丝裂原活化蛋白激酶10?(mitogen-activated?protein?kinase,MAPK10)?基因序列,并分析其组织mRNA和蛋白表达情况.[方法]采用PCR技术扩增丽江猪MAPK10基因,并利用生物信息学软件对获得的序列进行分析,实时荧光定量PCR检测丽江猪脑、肝脏、心脏、脾脏、肺脏、肾脏、胰脏、背脂和背最长肌等9种组织中MAPK10基因的相对表达量;以大白猪为对照,实时荧光定量PCR和Western-blot-ting检测丽江猪与大白猪背脂中mRNA和蛋白表达差异.[结果]MAPK10基因序列总长1281?bp,编码426个氨基酸;MAPK10蛋白属亲水蛋白,无跨膜结构和信号肽,有44个磷酸化位点和2个糖基化位点;二级结构以α-螺旋和无规则卷曲为主;丽江猪MAPK10基因序列与人、牛、山羊、绵羊、鼠、狗、猴和鸡的同源性分别为95.3％、93.5％、93.2％、93.0％、92.6％、91.2％、90.5％和85.6％;MAPK10基因在丽江猪9个组织中差异表达,以脑中最高;丽江猪背脂MAPK10基因的mRNA表达量极显著低于大白猪?(P<0.01),蛋白表达量也有低于大白猪的趋势?(P>0.05).[结论]MAPK10基因可作为研究丽江猪脂肪沉积性状的候选基因,结果可为研究猪脂肪沉积提供参考.