云计算下的基因测序数据并行化生成方法

• 作者: 刘志明 冉昊
• 来源期刊: 计算机仿真
• 学科: 工学
• 关键词: 云计算 基因测序 并行计算 数据生成 聚类算法
• 年，卷（期）: 2022,（2）
• 所属期刊栏目: 仿真应用研究
• 页码范围: 246-250
• 页数: 5页
• 分类号: TP391
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1006-9348.2022.02.047

摘要

传统基因测序数据生成方法对聚类的起始和终止判断不准确,导致测序数据生成速度慢,且无法对基因特征实现精准表达.为强化描述测序数据与基因之间的关联程度,优化基因测序数据生成效率,提出云计算下的基因测序数据并行化生成方法.利用主成分分析法,建立初始数据特征子集,获取综合数据指标,构建描述特征集合的系数矩阵,计算特征值与特征向量,保留方差贡献值较高的数据,完成降维处理.设计具有应用层、服务层与资源层的云架构体系,确定云平台组件.结合基因数据发展特征,验证基因中是否存在污染物,控制测序数据质量;根据聚类算法的反单调特性,将最小矩阵作为起点,通过阈值判断能否生成聚类.当聚类结束时,得到生成的并行化测序数据.实验表明,上述方法效率高,且生成的数据能够准确表达出基因特性.