mRNA三级结构中局部碱基对参量与蛋白质折叠速率的相关性

• 作者: 赵瑞峰 李瑞芳 程永霞 宋鑫伟
• 来源期刊: 内蒙古师范大学学报（自然科学汉文版）
• 学科: 生物学
• 关键词: RNA三级结构 局部碱基对参量 蛋白质折叠速率 显著相关性
• 年，卷（期）: 2022,（3）
• 页码范围: 292-298
• 页数: 7页
• 分类号: Q61
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-8735.2022.03.011

摘要

为研究mRNA三级结构对蛋白质折叠速率的影响,首先计算所选蛋白质相应mRNA的三级结构,在此基础上计算局部碱基对参量,分析这些参量对蛋白质折叠速率的影响;然后将所选蛋白质按照不同的蛋白质折叠类型和二级结构进行分组,进而分析局部碱基对参量与不同类蛋白质折叠速率的相关性.结果表明,局部碱基对参量中两碱基原点y轴方向相对位移(Stretch)、两碱基原点z轴方向相对位移(Stagger)、两碱基平面绕x轴旋转夹角(Buckle)和绕y轴旋转夹角(Propeller)均与蛋白质折叠速率存在相关性,说明mRNA三级结构的局部碱基对参量是影响蛋白质折叠速率的有效因素.