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大豆GmFtsH2基因的克隆及表达分析
大豆GmFtsH2基因的克隆及表达分析
作者:
金勋
杨柳
潘红丽
芮海英
王丽娜
李娜
李泽宇
基本信息来源于合作网站,原文需代理用户跳转至来源网站获取
大豆
FtsH
逆境胁迫
表达分析
摘要:
为了进一步了解FtsH基因在大豆中的表达特性和功能,通过GenBank中拟南芥等其他植物FtsH基因序列设计1对简并引物,从盐处理的大豆叶片中克隆GmFtsH2的全长cDNA序列,并利用在线生物信息学软件对其进行分析.采用实时荧光定量PCR方法分析GmFtsH2在低温、盐、干旱和高温处理下的表达情况.从大豆中克隆到一条全长为2200 bp的mRNA序列,命名为GmFtsH2基因,开放阅读框2091 bp,编码696个氨基酸,相对分子量约为75.089 kDa,理论等电点为5.65,蛋白质不稳定系数为34.90,是稳定蛋白.大豆GmFtsH2与来源于三叶草、葡萄、水稻、玉米和拟南芥类的FtsH类同源蛋白的氨基酸序列比对发现,这些蛋白具有FtsH蛋白共同的保守结构域,包括N端两个跨膜域、AAA结构域、锌离子结合模块等.大豆GmFtsH2与其他19种植物FtsH蛋白的系统进化分析表明,与野生豆和菜豆两个蛋白的亲缘关系较近.RT-PCR分析表明,GmFtsH2在大豆的叶片、茎、根、茎尖的组织内均有表达,且在茎尖中表达量最高,茎中最低.大豆叶片在4℃低温和NaCl处理下,GmFtsH2的表达随时间延长逐渐被诱导,分别在处理后的9 h和12 h达到最高峰;而经干旱诱导的大豆叶片,GmFtsH2的表达在第3天达到最高峰,随后GmFtsH2的表达下调,第11天又达到一个小高峰.推测GmFtsH2在大豆抵御逆境胁迫中起作用.
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文献信息
篇名
大豆GmFtsH2基因的克隆及表达分析
来源期刊
黑龙江农业科学
学科
关键词
大豆
FtsH
逆境胁迫
表达分析
年,卷(期)
2022,(1)
所属期刊栏目
育种栽培|Breeding and Cultivation
研究方向
页码范围
6-13,19
页数
9页
分类号
字数
语种
中文
DOI
10.11942/j.issn1002-2767.2022.01.0006
五维指标
传播情况
被引次数趋势
(/次)
(/年)
引文网络
引文网络
二级参考文献
(0)
共引文献
(0)
参考文献
(0)
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同被引文献
(0)
二级引证文献
(0)
2022(0)
参考文献(0)
二级参考文献(0)
引证文献(0)
二级引证文献(0)
研究主题发展历程
节点文献
大豆
FtsH
逆境胁迫
表达分析
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
黑龙江农业科学
主办单位:
黑龙江省农业科学院编辑出版中心
出版周期:
月刊
ISSN:
1002-2767
CN:
23-1204/S
开本:
大16开
出版地:
哈尔滨市南岗区学府路368号
邮发代号:
14-61
创刊时间:
1978
语种:
chi
出版文献量(篇)
8933
总下载数(次)
26
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