15株湖南省猪圆环病毒2型全基因组测序与遗传进化分析

• 作者: 何世成 王紫微 丁朝阳 胡巧云 唐小明 王卫国 谢怡灵 王昌建
• 来源期刊: 中国动物检疫
• 学科: 农学
• 关键词: 猪圆环病毒2型 全基因扩增 遗传进化分析 湖南
• 年，卷（期）: 2022,（2）
• 所属期刊栏目: 流行病学
• 页码范围: 33-39,81
• 页数: 8页
• 分类号: S852.65
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-944X.2022.02.007

摘要

为了解湖南省猪圆环病毒2型(PCV2)的遗传变异情况,以PCV2检测阳性样本DNA为模板进行全基因组测序和遗传特征分析.共获得的15株PCV2全基因组,其中10株为PCV2d基因亚型,3株为PCV2b基因亚型,2株为PCV2a基因亚型;15株PCV2全基因组同源性为94.7％～99.9％,与国内外其他PCV2全基因组同源性为93.1％～100％.PCV2a的第77、86～91、151、206和222位,PCV2b的第57、89及210位,PCV2d的第53、68、121、134、215和234位氨基酸与其他亚型存在差异.结果表明,2017—2020年湖南省主要流行PCV2d亚型,不同亚型之间ORF2氨基酸序列差异较大,但同亚型之间氨基酸序列无明显变异.本研究为湖南省PCV2研究及该病防治提供了数据支撑.