茶树12个酚类物质合成途径关键酶SSR分子标记的开发及应用

• 作者: 彭靖茹 檀业维 温立香 张芬 黄寿辉 陈家献 袁冬寅 赵媛
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 茶树 SSR标记 酚类合成酶 遗传多样性 核心种质
• 年，卷（期）: 2022,（5）
• 所属期刊栏目: 研究论文与报告|Articles and Letters
• 页码范围: 825-836
• 页数: 12页
• 分类号: S571.1
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2022.05.001

摘要

茶多酚是茶树(Camellia sinensis)的主要次级代谢产物,与茶树的新陈代谢、生长发育及品质非常密切.茶树酚类物质的合成涉及多种酶.目前针对茶树酚类合成途径特定酶开发的SSR分子标记引物及应用还较少.本研究基于茶树全基因组序列,以茶树酚类物质合成途径12个关键酶的基因及其侧翼序列开发获得了158对SSR分子标记引物,其中类黄酮3'-羟化酶开发获得的SSR引物最多,有29对,肉桂酸羟化酶最少,只有1对.所开发的158对SSR引物,位于基因间隔区的最多,依次是内含子区、上游区及外显子区,位于5′端上游非编码区的最少.这些引物总计有122个重复单元,其中二核苷酸最多,之后依次为三核苷酸、四核苷酸及五核苷酸,最少的是六核苷酸.从158对SSR引物中挑选68对进行了引物多态性筛选,将获得的13对多态性好的引物开展72份茶树种质资源遗传多样性的研究,共获得105种带型,同一样品的重复样可聚在一起,表明所筛选的引物能很好地区分种质资源,具有较好的准确性.72份茶树种质资源的遗传相似系数为0.8120～0.9849.本研究为茶树基于主要内含物酚类物质开展核心种质构建、新品种选育及品种鉴定等提供依据,同时也可为针对特定基因开发SSR分子标记提供参考方法.