新分离登革2型病毒福建株基因组全序列的测定

• 作者: 于曼 李晓萸 杨佩英 秦鄂德 耿丽卿 胡志君 苑锡同 赵卫
• 来源期刊: 中华微生物学和免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 登革病毒 全序列测定 系统发生树 基因型
• 年，卷（期）: 2001,（3）
• 所属期刊栏目: 病毒学
• 页码范围: 330-333
• 页数: 4页
• 分类号: R37
• 字数: 3230字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3760/j:issn:0254-5101.2001.03.034

摘要

目的对新近分离的导致1999年福建省登革热流行的登革2型病毒FJ-10株进行基因组全序列测定及系统发生树分析。方法利用RT-PCR和5′、3′RACE法扩增FJ-10株cDNA，并进行克隆测序。利用DNASTAR软件的Clustal方法绘制系统发生树。结果 FJ-10株基因组全长10723个核苷酸，有1个单一开放读码框架（ORF,第97～10269nt），编码3391个氨基酸，5′和3′非编码区长度分别为96和454个核苷酸。通过与标准株NGC株和我国其他地区分离株DEN2-04、43、44株比较，核苷酸同源性分别为94.0%、92.8%、93.9%和93.9%，氨基酸同源性分别为97.9%、97.2%、97.7%和97.9%。以47株登革2型病毒E/NS1连接区240个核苷酸序列进行系统发生树分析，福建株与印度尼西亚和斯里兰卡分离株亲缘关系较近，同属于第Ⅳ基因型。结论 FJ-10株基因组全序列一级结构与其他登革2型病毒类似，其基因型不同于我国其他地区分离株DEN2-04、43和44株。

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	秦鄂德		75	476	11.0	17.0
2	于曼		43	174	7.0	9.0
3	胡志君		16	70	6.0	8.0
4	赵卫		16	106	6.0	10.0
5	杨佩英		27	182	8.0	12.0
6	苑锡同		6	28	3.0	5.0
7	李晓萸		12	100	6.0	9.0
8	耿丽卿		6	33	4.0	5.0