酵母、大肠杆菌和枯草杆菌基因组中短ORF的分布与形成原因

• 作者: 李宏
• 来源期刊: 生物物理学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 酵母 大肠杆菌 枯草杆菌 组分约束下的随机序列 开阅读框架分布
• 年，卷（期）: 2002,（3）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 307-312
• 页数: 6页
• 分类号: Q615
• 字数: 5371字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-6737.2002.03.009

摘要

用终止密码方法计算了酵母、大肠杆菌和枯草杆菌基因组中所有的第一类开阅读框架(记为理论ORF),给出了理论ORF和已知ORF随长度的分布,发现长度大于150个氨基酸后,理论ORF与已知ORF分布基本趋于一致,小于150个氨基酸的理论ORF数目的对数随长度线性变化,并提出这些短ORF是随机产生的猜想;研究了组分约束下的随机DNA序列中ORF数目、ORF的长度与随机序列总长度和GC含量之间的关系,证明了本文猜想的正确性;给出了短的理论ORF中可能的编码序列所占比例的分布曲线,这对识别短的编码序列有参考价值.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李宏	内蒙古大学理工学院物理系	160	656	14.0	18.0