猪细小病毒SC-1株VP2基因的克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘艳丽 殷华平 罗燕 郭万柱
• 来源期刊: 动物医学进展
• 学科: 农学
• 关键词: 猪细小病毒 猪细小病毒SC1 VP2基因 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2005,（8）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 87-91
• 页数: 5页
• 分类号: S852.659.2|Q785
• 字数: 3515字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1007-5038.2005.08.025

摘要

根据PPV NADL-2株基因组序列设计了一对引物,以复制型DNA为模板,通过PCR 扩增出长约2.0 kb的DNA片段,将其插入克隆载体质粒pUC19,构建重组质粒pPVP2,测序显示PPV-SC-1 VP2基因全长1 740 bp,共编码579个氨基酸.多序列比对结果显示,猪细小病毒VP2基因保守性强,仅存在个别的差异;密码子偏向性分析结果表明,PPV-SC-1 VP2基因在同一氨基酸的不同密码子的选择上存在一定的偏向性,并且与PPV-SC-1 NS1在密码子的偏向性上具有相同的属性,主要偏向于使用以A结尾的密码子;氨基酸疏水性分析表明,PPV-SC-1 VP2蛋白在77～82、291～304、362～373、400～411、465～477等位点存在较明显的亲水区段;跨膜区结构分析显示该蛋白不存在显著意义的跨膜区;分析该蛋白的抗原位点可能位于60～68、81～88、266～275、351～357、398～404位点处.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	郭万柱	四川农业大学动科院动物生物技术中心	166	1465	21.0	28.0
2	殷华平	四川农业大学动科院动物生物技术中心	12	129	8.0	11.0
3	刘艳丽	四川农业大学动科院动物生物技术中心	4	71	3.0	4.0