中华鳖群体间编码MHCⅠ类分子α2结构域基因的克隆及序列分析

• 作者: 刘至治 李思发 蔡完其
• 来源期刊: 水产学报
• 学科: 农学
• 关键词: 中华鳖 群体 克隆 遗传变异 主要组织相容性复合体(MHC)
• 年，卷（期）: 2006,（2）
• 页码范围: 197-203
• 页数: 7页
• 分类号: Q785|S917
• 字数: 5156字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-0615.2006.02.010

摘要

通过主要组织相容性复合体(MHC)基因的分析,探讨了中华鳖5个群体(黄河、淮河、洞庭湖、鄱阳湖、太湖)间的遗传变异与分化.中华鳖编码MHC I类分子α2结构域基因的多态性很丰富.主要表现在:(1)中华鳖编码MHC I类分子α2结构域的基因序列存在插入或缺失变异,共获得7种不同长度的基因序列,其中222 bp、231 bp分别在42、23个体出现,为两种主要长度的基因序列;(2)共获得41种不同的核苷酸序列,这些核苷酸序列的相似度在0.386～0.995之间,表明序列间的歧异度较大;(3)在所有核苷酸序列中,共有250个有效位点,其中174个为变异位点,多态位点百分率达69.6%,但群体间存在差异:①多态位点百分率大小顺序为鄱阳湖鳖(71.02% )> 太湖鳖(58.05%) >淮河鳖(57.69% )>黄河鳖(55.32% )> 洞庭湖鳖(48.09%);②核苷酸多样性指数(π)大小顺序为鄱阳湖鳖(0.4273)>太湖鳖(0.2872)>洞庭湖鳖(0.2840)>黄河鳖(0.2727)>淮河鳖(0.2463);(4)分子方差分析(AMOVA)表明,太湖鳖与黄河鳖、淮河鳖2群体间,淮河鳖与洞庭湖鳖间有极显著的遗传分化(P<0.001);(5)根据核苷酸序列的平均遗传距离,用UPGMA 和NJ法进行聚类分析,黄河鳖与淮河鳖、洞庭湖鳖与太湖鳖分别先聚在一起,最后再与鄱阳湖鳖聚类,显示鄱阳湖鳖与其它4群体中华鳖在MHC基因上有明显歧化.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李思发	上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	78	1770	26.0	39.0
2	蔡完其	上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	30	970	18.0	30.0
3	刘至治	上海水产大学农业部水产种质资源与养殖生态重点开放实验室	7	215	7.0	7.0