华支睾吸虫CsSP16.4基因的克隆、序列分析和功能预测

• 作者: 余新炳 徐劲 李军涛 胡旭初 谢红艳 陈守义 魏泉德
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 医学
• 关键词: 华支睾吸虫 分泌蛋白 克隆
• 年，卷（期）: 2006,（4）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 298-300
• 页数: 3页
• 分类号: R393.2
• 字数: 2718字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2006.04.003

摘要

目的通过筛选cDNA文库识别华支睾吸虫新基因;克隆并构建重组表达载体,为进一步研究其功能及其应用价值奠定基础.方法对华支睾吸虫cDNA文库进行筛选,通过Blastn程序进行序列比对,识别华支睾吸虫新基因,并应用Motifscan,NCBI Conserved Domain Search 等程序对其进行结构域分析及进化树分析.结果筛选得到的序列长725bp,应用Vecter NTI 分析,理论分子量为16.4kDa,理论等电点(pI)为6.44,疏水氨基酸(AILFWV)占36%,带电荷氨基酸(RKHYCDE)占29%,极性氨基酸 (NCQSTY) 占28.8%,酸性氨基酸(DE) 占8.65%和碱性氨基酸(KR)占9.21%.应用NCBI站点的ORF Finding分析发现其含4个可能的ORF, 其中最长的ORF,从第42到第494 bp,起始密码为ATG、终止密码为TAG,完整阅读框含450 bp,编码150 aa.发现该基因有潜在的2个糖激化位点、3个N肉豆蔻酰化位点和1个蛋白激酶C磷酸化位点.结论确定该基因为华支睾吸虫分泌蛋白基因,为作为诊断候选抗原提供了依据.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	余新炳	中山大学基础医学院	201	1352	17.0	28.0
2	徐劲	中山大学基础医学院	104	568	13.0	17.0
3	胡旭初	中山大学基础医学院	108	574	13.0	17.0
4	陈守义		31	211	8.0	13.0
8	魏泉德	中山大学基础医学院	4	26	3.0	4.0
9	李军涛		4	25	2.0	4.0
13	谢红艳	中山大学基础医学院	5	16	3.0	3.0