稻瘟病菌发育cDNA文库构建与表达序列标签分析

• 作者: 娄沂春 彭友良 戴承恩 方永启 李德葆 李有志 董海涛 邓晔 邵菁 金庆超 陈保善
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 稻瘟病菌 cDNA文库 表达序列标签
• 年，卷（期）: 2006,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 963-969
• 页数: 7页
• 分类号: S188
• 字数: 6396字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2006.06.027

摘要

利用稻瘟病菌(Magnaporthe griesa)连续6个发育时期的材料构建了一个混合cDNA文库.文库滴度,重组率和插入片段长度等质量分析表明,构建的文库包含完整的稻瘟病菌基因,可用于病菌基因表达分析.利用该文库获得了7 456条5′端表达序列标签(ESTs)(GenBank收录号:(CK909944～CK913666和CK928583～CK932582),生物信息分析表明:EST序列拼接出2 975个假定独立转录本(TUTs),冗余度为60.1%;从cDNA文库中筛选出大量的低丰度表达基因,约占TUT总数的79.8%,说明在文库中基因组成类型的复杂性较高;在所有TUTs中,功能未知基因约占85.5%,编码ECM33蛋白和疏水蛋白等病菌致病相关的注释基因高丰度表达,进一步表明该cDNA文库反映了病菌侵染和发育过程中基因表达的状况.