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摘要:
用分子对接的方法,对利迪链菌素的抗HIV蛋白酶活性进行了研究.为了更准确地反映利迪链菌素分子与酶蛋白结合的情况,充分考虑受体活性部位的柔性,采用了FlexX(初步对接)和Flexidock(精确对接)分两步将配体与受体进行对接.在初步对接中,设计了不同的受体活性部位来考察是否有结合水分子参与抑制剂与酶的结合.对一种作用方式已知的非肽类HIV蛋白酶抑制剂Aha006进行的对接研究显示,分子模拟的结果与实际情况吻合得较好,证明了本文所采用的方法的可靠性.利迪链菌素与蛋白酶活性部位的对接结果显示,配体分子与受体之间的结合没有结合水分子的参与,两者通过5对氢键作用结合成为稳定的复合物.利迪链菌素占据结合腔,覆盖了蛋白酶的活性三联体Asp25-Thr26-Gly27,从而起到抑制其生物活性的作用.
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文献信息
篇名 HIV蛋白酶抑制剂——利迪链菌素的分子对接研究
来源期刊 化学学报 学科 化学
关键词 HIV-1蛋白酶抑制剂 利迪链菌素 分子模拟 分子对接
年,卷(期) 2006,(24) 所属期刊栏目 研究论文
研究方向 页码范围 2491-2495
页数 5页 分类号 O6
字数 3220字 语种 中文
DOI 10.3321/j.issn:0567-7351.2006.24.018
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 元英进 天津大学化工学院制药工程系 195 3205 29.0 46.0
2 李艳妮 天津大学化工学院制药工程系 15 51 3.0 7.0
3 李金涛 天津大学化工学院制药工程系 1 4 1.0 1.0
传播情况
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研究主题发展历程
节点文献
HIV-1蛋白酶抑制剂
利迪链菌素
分子模拟
分子对接
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
化学学报
月刊
0567-7351
31-1320/O6
大16开
上海市零陵路345号
4-209
1933
chi
出版文献量(篇)
7168
总下载数(次)
8
相关基金
国家自然科学基金
英文译名:the National Natural Science Foundation of China
官方网址:http://www.nsfc.gov.cn/
项目类型:青年科学基金项目(面上项目)
学科类型:数理科学
论文1v1指导