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摘要:
目的对肿瘤基因组解剖计划获得的海量数据进行充分数据挖掘,筛选胃癌差异表达基因.方法采用数字化基因差异显示技术对肿瘤基因组解剖计划数据库中的4个胃癌和2个正常胃组织文库共300,783条基因表达系列分析数据进行了分析.结果筛选出差异表达的已知基因136个,其中胃癌中表达上调的有54个,下调82个,EST序列65条,其中上调24条,下调41,虚拟Northern和数字化显示对筛选出的差异表达基因PTMA构建了全身正常组织和肿瘤组织的基因表达图谱.结论充分利用生物信息学工具可以快速有效地筛选肿瘤差异表达基因,指导后续分子生物学实验研究.筛选出来的差异表达基因通过验证,有望成为新的胃癌分子靶标.
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生物信息学
肿瘤
数字化差异显示
EST
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文献信息
篇名 利用基因表达系列分析数据库进行数字化基因差异显示筛选胃癌相关基因
来源期刊 中国医师杂志 学科 医学
关键词 胃肿瘤 基因组 基因组学 自动数据处理
年,卷(期) 2006,(3) 所属期刊栏目 肿瘤学研究专题
研究方向 页码范围 302-305
页数 4页 分类号 R73
字数 1810字 语种 中文
DOI 10.3760/cma.j.issn.1008-1372.2006.03.005
五维指标
作者信息
序号 姓名 单位 发文数 被引次数 H指数 G指数
1 熊炜 中南大学肿瘤研究所 26 101 6.0 9.0
2 阳菊华 福建医科大学分子医学研究中心 18 48 4.0 5.0
3 熊芳 中南大学信息科学与工程学院 13 40 4.0 5.0
7 肖大光 中南大学信息科学与工程学院 17 111 7.0 10.0
8 曾朝阳 中南大学肿瘤研究所 13 85 4.0 9.0
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研究主题发展历程
节点文献
胃肿瘤
基因组
基因组学
自动数据处理
研究起点
研究来源
研究分支
研究去脉
引文网络交叉学科
相关学者/机构
期刊影响力
中国医师杂志
月刊
1008-1372
43-1274/R
大16开
长沙市芙蓉区新军路43号中国医师杂志社518办公室
42-141
1995
chi
出版文献量(篇)
18756
总下载数(次)
13
相关基金
福建省青年科技人才创新基金
英文译名:
官方网址:
项目类型:申报项目有农业、环保、机电、海洋、生物、新材料等10多种
学科类型:
论文1v1指导