华支睾吸虫ATP合酶B亚基全长基因的生物信息学分析

• 作者: 余新炳 周红娟 徐劲 胡旭初
• 来源期刊: 热带医学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 华支睾吸虫 ATP合酶B亚单位 生物信息学
• 年，卷（期）: 2007,（4）
• 所属期刊栏目: 基础研究论著
• 页码范围: 315-318
• 页数: 4页
• 分类号: R383.22
• 字数: 4540字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-3619.2007.04.005

摘要

目的 从华支睾吸虫全长cDNA质粒文库中识别ATP合酶B亚基,利用生物信息学方法预测其结构和功能特征,用以指导实验研究.方法 利用生物信息学网站的各种在线分析工具和Vector NTI suite软件包,识别华支睾吸虫ATP合酶B亚基基因并预测编码蛋白质的各种结构与功能特征,并根据该基因构建种系分子进化树.结果 Blastx分析该基因为全长基因,属于ATP合酶B亚基家族,其分子进化树与种系进化过程非常吻合.该基因全长1 008 bp,编码300个氨基酸,含有线粒体转运肽、两个跨膜区、一个核定位序列和多个磷酸化位点,具有较稳定的理化性质.结论 ATP合酶B亚基是一个理想的真核种系进化的分子标志.华支睾吸虫ATP合酶B亚基具有线粒体和细胞核的双重定位序列,提示该蛋白可能在华支睾吸虫的能量代谢途径中发挥独特的调节作用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	余新炳	中山大学中山医学院寄生虫学教研室	201	1352	17.0	28.0
2	徐劲	中山大学中山医学院寄生虫学教研室	104	568	13.0	17.0
3	胡旭初	中山大学中山医学院寄生虫学教研室	108	574	13.0	17.0
4	周红娟	中山大学中山医学院寄生虫学教研室	2	32	2.0	2.0