杜氏盐藻光系统Ⅱ反应中心蛋白D2 基因的克隆及序列分析

• 作者: 刘红涛 宋建伟 王鹏举 臧卫东 薛乐勋 鲁照明
• 来源期刊: 华中师范大学学报（自然科学版）
• 学科: 生物学
• 关键词: 杜氏盐藻 D2蛋白 psbD 简并引物 密码子偏爱性
• 年，卷（期）: 2007,（3）
• 页码范围: 431-436
• 页数: 6页
• 分类号: Q785
• 字数: 4142字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-1190.2007.03.026

摘要

根据莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii)、Oryza sativa、Chlorella vulgaris以及Mesostigma viride 等真核生物的psbD基因的氨基酸高度保守序列,设计一对简并引物,利用TRIzol试剂提取杜氏盐藻(Dunaliella salina)细胞的总RNA,通过RT-PCR,得到杜氏盐藻cDNA片段的长度大约为1 000bp.该序列的PCR产物经T-A克隆并测序分析以及测序结果推导成氨基酸序列,Blast同源性分析表明所克隆的基因为杜氏盐藻psbD基因,编码杜氏盐藻光系统Ⅱ反应中心D2蛋白,该序列已递交GenBank(GenBank登录号为:DQ074450).编码的氨基酸序列,同源性依次为:Chlamydomonas reinhardtii 92%,Nephroselmis olivacea 88%,Pinus thunbergii 88%,Amborella trichopoda 88%,Chlorella vulgaris 88%.通过密码子偏爱性分析表明,psbD基因存在明显的密码子偏爱性,其(A+T)含量明显高于(G+C)含量.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	薛乐勋	郑州大学医学实验中心	140	1187	18.0	26.0
2	臧卫东	郑州大学医学实验中心	91	279	8.0	10.0
3	刘红涛	郑州大学医学实验中心	60	431	11.0	18.0
4	鲁照明	郑州大学医学实验中心	29	112	6.0	9.0
5	宋建伟	郑州大学医学实验中心	14	24	2.0	4.0
6	王鹏举	郑州大学医学实验中心	10	14	2.0	3.0