番木瓜环斑病毒海南分离物全基因组结构分析

• 作者: 卢雅薇 周鹏 唐清杰 沈文涛 牛艳梅
• 来源期刊: 广东农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 番木瓜环斑病毒 全基因组 同源性 系统进化树
• 年，卷（期）: 2007,（9）
• 所属期刊栏目: 植物保护
• 页码范围: 54-58
• 页数: 5页
• 分类号: Q781|S432.4+1
• 字数: 4257字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-874X.2007.09.020

摘要

从感病的海南番木瓜叶片中提取总RNA,经RT-PCR和RACE方法分段扩增番木瓜环斑病毒(PRSV)全基因组序列.序列拼接结果显示,PRSV中国海南分离株(HaiNan-P)基因组除3'-末端polyA尾巴外,由10323个核苷酸组成,编码3343个氨基酸.同源性分析表明,HaiNan-P编码的氨基酸序列与GenBank中公布的11株PRSV同源性为89.8%～93.2%,略高于全长核苷酸的82.3%～89.1%.P1蛋白编码区同源性较低,仅为65.4%～80.1%,而HC-Pro、CI及CP同源性相对较高.运用MEGA 3.1软件、NJ法绘制系统进化树,分析结果显示,PRSV分离株类群分化与地理分布有一定的相关性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周鹏	中国热带农科院热带生物技术研究所/热带作物生物技术国家重点实验室	129	1451	21.0	32.0