杨树派间不同种的遗传密码子使用频率分析

• 作者: 周猛 施季森 童春发
• 来源期刊: 遗传学报
• 学科: 农学
• 关键词: 杨树 密码子使用频率 高频密码子 密码子偏爱性
• 年，卷（期）: 2007,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 555-561
• 页数: 7页
• 分类号: S7
• 字数: 1347字
• 语种: 中文

摘要

遗传密码子的简并性特征造成了不同物种使用的密码子存在偏爱性.了解不同物种的密码子使用特点,可以为外源基因导入过程中的基因改造提供依据,从而实现外源基因的高效表达.杨树是世界上广泛栽培的重要造林树种之一,已经成为林木基因工程研究的模式植物.本研究采用高频密码子分析法,对美洲山杨P.tremuloides,毛白杨P.tomentosa,美洲黑杨P.deltoids和毛果杨P.trichocarpa 4种杨树的蛋白质编码基因序列(CDS)进行了分析,计算出了杨树同义密码子相对使用频率(RFSC),确定了4种杨树的高频率密码子,发现虽然不同种类的杨树密码子使用上有一些差别,但是偏爱密码子的差别却很小,共性的密码子占绝大多数.仅有Pro,Thr和Cys等少数几个氨基酸的偏爱密码子有差别.这种"共性"提示我们,用不同种的杨树中任何一种杨树的偏爱密码子所设计的外源基因在其他杨树中也可以使用.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	施季森	南京林业大学国家林业局和江苏省林木遗传和基因工程重点实验室	218	3785	32.0	50.0
2	童春发	南京林业大学国家林业局和江苏省林木遗传和基因工程重点实验室	20	170	8.0	12.0
3	周猛	南京林业大学国家林业局和江苏省林木遗传和基因工程重点实验室	5	34	3.0	5.0