茶树多酚氧化酶基因的SNP分析

• 作者: 刘仲华 李家贤 罗军武 黄建安 黄意欢 龚志华
• 来源期刊: 湖南农业大学学报(自然科学版)
• 学科: 农学
• 关键词: 茶树 多酚氧化酶基因 单核苷酸多态性
• 年，卷（期）: 2007,（4）
• 所属期刊栏目: 茶学
• 页码范围: 454-458,485
• 页数: 6页
• 分类号: S571.1|Q523
• 字数: 3836字
• 语种: 中文

摘要

选取有代表性的40个茶树品种(系)为材料,先采用PCR-SSCP-银染检测技术,对供试材料的多酚氧化酶(PPO)基因进行SSCP分析,对PPO基因作初步基因分型;根据分型分析结果,对每一类型选择典型品种的PPO基因作进一步的DNA序列分析,用DNASTAR Program 进行单核苷酸多态性(SNP)搜寻.结果表明,茶树PPO基因存在丰富的SNP,其类型包括:转换(A←→G,C←→T)、颠换(A←→T,G←→C,G→T,A→C)与杂合子(C/T,A/G,G/T,A/T,A/C,G/C).在发现的37个SNPs中,有13个SNPs发生在核酸内切酶酶切位点,有10个错义SNPs位点导致氨基酸的改变.在PPO基因的保守序列区,出现SNP的频率较低.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘仲华	湖南农业大学茶学教育部重点实验室	290	3512	31.0	42.0
2	罗军武	湖南农业大学茶学教育部重点实验室	96	1371	19.0	33.0
3	龚志华	湖南农业大学茶学教育部重点实验室	73	1301	21.0	33.0
4	黄建安	湖南农业大学茶学教育部重点实验室	147	2512	28.0	42.0
5	黄意欢	湖南农业大学茶学教育部重点实验室	20	695	12.0	20.0