口蹄疫病毒WFL株2C-P3-3'NCR片段的克隆及适于设计siRNA的序列分析

• 作者: 任林柱 刘锴 孙大辉 张辉 王兴龙 王学理
• 来源期刊: 中国生物制品学杂志
• 学科: 农学
• 关键词: 口蹄疫病毒 基因组 小干扰RNA 克隆 序列分析
• 年，卷（期）: 2007,（7）
• 所属期刊栏目: 基础研究
• 页码范围: 489-492
• 页数: 4页
• 分类号: S855.3
• 字数: 2387字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-5503.2007.07.005

摘要

目的 筛选出口蹄疫病毒(FMDV)基因组上适于设计siRNA的基因片段.方法 以FMDV WFL株RNA为模板,用3'RACE法扩增出2C-P3-3'NCR序列,将PCR扩增片段克隆到pMD18-T载体上,转化E.coli DH5α,筛选阳性重组子,进行序列测定,并与参考毒株序列比较.结果 扩增的基因片段大小为4 033 bp,其2C、P3和3'NCR序列的核苷酸序列与参考毒株的同源性分别为87.11%～94.23%、84.91%～96.66%和66.98%～82.35%,2C和P3与参考毒株的氨基酸同源性分别为94.97%～99.39%和91.84%～98.55%,WFL株P3基因的第1 150～1 270、1 680～1 840和2 080～2 490 bp以及2C基因的第354～470 bp范围内与参考毒株具有高度保守的特性.因此,可以依据siRNA设计原则,在这4个区域内筛选抑制效果好的siRNA.结论 成功克隆了FMDV WFL株2C-P3-3'NCR基因的序列,并筛选出4个适于设计siRNA的基因区段.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙大辉	吉林大学第一医院骨关节一科	58	505	12.0	20.0
2	刘锴	吉林大学畜牧兽医学院动物生物技术系	12	35	3.0	5.0
3	王兴龙	军事医学科学院军事兽医研究所动物性食品研究室	49	465	11.0	20.0
4	任林柱	吉林大学畜牧兽医学院动物生物技术系	39	95	5.0	8.0
6	张辉	吉林大学畜牧兽医学院动物生物技术系	99	615	15.0	20.0
9	王学理	吉林大学畜牧兽医学院动物生物技术系	7	11	2.0	3.0