甘薯抗病基因同源序列的克隆与分析

• 作者: 何国浩 王荣富 王钰
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 甘薯 简并引物 抗病基因同源序列(RGA) 克隆
• 年，卷（期）: 2008,（3）
• 页码范围: 81-86
• 页数: 6页
• 分类号: Q785|S435.311
• 字数: 3686字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-2030.2008.03.016

摘要

对根据紫花苜蓿(Medicago truncatula)NBS区域的保守序列等设计的16对简并引物进行优化,筛选出6对简并引物,以甘薯的基因组DNA为模板进行PCR扩增,克隆甘薯抗病基因同源序列(RGA).结果克隆出342个不同的甘薯RGA,这342个甘薯RGA和已知的抗病基因L6、N、RGC1等具有高度同源性(E value<e×10-20).根据抗病基因同源序列的相似性,利用Cluxtalw软件将其分为22个不同的类群.这些甘薯的抗病基因同源序列已提交GenBank(编号:DQ903322至DQ903664).在342个甘薯RGA中,除7个是TIR外,其余属于non-TIR类型.用Blastx和DNAman 软件对342个甘薯RGA进行列队比较,发现有9个含有抗线虫病RGC1序列的RGA,它们与RGC1的同源性为50%～100%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	王荣富	安徽农业大学生命科学学院	81	1328	17.0	33.0