玉米黑粉菌基因组编码蛋白作用位点的计算机预测

• 作者: 何月秋 吴毅歆 范成明 黄婉
• 来源期刊: 西南农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米黑粉病菌 基因组 亚细胞作用位点 计算机预测
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 所属期刊栏目: 植物保护·土壤肥料
• 页码范围: 84-86
• 页数: 3页
• 分类号: S513.032
• 字数: 2492字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1001-4829.2008.01.019

摘要

利用巴公布的玉米黑粉病菌基因组全序列数据及信号肽预测软件SignalP v3.0、亚细胞器中蛋白定位分布预测软件Tar-getP v1.01、跨膜螺旋结构预测软件TMHMM v2.0和膜锚定位点预测软件Big-PI Predictor预测分析了玉米黑粉病菌基因组编码蛋白的作用位点.结果表明.在6522个ORF中,具有分泌功能的有543个,占全基因组基因总数的8.3%;作用位点在线粒体的有1552个,占全基因组基因总数的23.4%;具有跨膜结构的有1269个,占全基因组基因总数的19.5%;锚定在膜上的有56个,占全基因组基园总数的0.9%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴毅歆	云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室	84	513	13.0	18.0
3	何月秋	云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室	167	1909	24.0	36.0
9	黄婉	云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室	1	0	0.0	0.0
10	范成明	云南农业大学农业生物多样性与病虫害控制教育部重点实验室	13	291	9.0	13.0