新疆雪莲全长cDNA文库构建及表达序列标签(ESTs)特性分析

• 作者: 李芳 王博 王志方 罗明 艾秀莲
• 来源期刊: 新疆农业科学
• 学科: 农学
• 关键词: 新疆雪莲 cDNA文库 λTripLEx2 表达序列标签
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 页码范围: 56-60
• 页数: 5页
• 分类号: S580.1
• 字数: 3807字
• 语种: 中文

摘要

以野生新疆雪莲(Saussurea involucrata Kar.et Kit)为研究材料,利用Creator SMARTTM cDNA Library Construction技术构建了雪莲全长cDNA文库,从野生雪莲中提取总RNA和mRNA , 用分离到的微量mRNA合成cDNA第1链.通过长距离PCR扩增得到足够量的双链cDNA .将SfiⅠ酶切后并纯化的cDNA片段连接到经SfiⅠ酶切的噬菌体λTripIEX2上, 并对噬菌体进行包装,建成cDNA的全长库.经大肠杆菌XL1-Blue平板检测,原始文库滴度达4.03×107(pfu/mL).随机挑选500个克隆进行序列测定,PCR鉴定结果显示多数插入片段均在500 bp以上.将所测序列经GenBank检索和生物信息学比较,共有56个序列为非冗余数据.其中有14个cDNA片段序列在GenBank上无明显的同源性,42个片段与已报道的基因有较高的同源性.这些EST数据为进一步筛选和克隆雪莲特异性表达基因提供了材料平台,为雪莲基因组数据增补了大量信息.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	罗明		83	1376	23.0	35.0
2	艾秀莲	新疆农科院微生物所	12	89	6.0	9.0
3	王志方	新疆农科院微生物所	10	70	5.0	8.0
4	王博	新疆农科院微生物所	8	62	4.0	7.0
5	李芳		3	33	2.0	3.0