小鼠胚胎干细胞核心转录因子nanog靶基因Zbtb9的生物信息学分析

• 作者: 曹峰 李裕强
• 来源期刊: 西北农业学报
• 学科: 农学
• 关键词: 小鼠干细胞转录因子 nanog基因 Zbtb9基因 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2008,（5）
• 页码范围: 21-25
• 页数: 5页
• 分类号: S865.1+3
• 字数: 2956字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1004-1389.2008.05.005

摘要

通过特异性引物用RT-PCR方法扩增Zbtb9基因.利用生物信息学对小鼠的Zbtb9基因启动子进行生物信息学分析,预测Zbtb9基因启动子位置和启动子区内含有的转录因子结合位点,以及nanog在Zbtb9基因转录调控中的作用及Zbtb9蛋白的基本性质.Zbtb9基因启动子区可能定位于转录起始点上游790 bp至1 024 bp之间.启动子区内含有15个转录调控因子结合位点,nanog的作用靶序列位于Zbtb9基因启动子区与转录起始位点之间,提示nanog在Zbtb9基因转录调控中起作用,小鼠Zbtb9蛋白二级结构可能以螺旋为主,富含疏水性氨基酸;对Zbtb9基因疏水区的氨基酸进行跨膜区分析,提示可能是跨膜蛋白.经SMART分析,Zbtb9蛋白含有BTB/POZ结构域.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李裕强	西北农林科技大学动物医学院	10	92	6.0	9.0
2	曹峰	西北农林科技大学动物医学院	2	7	1.0	2.0