基于离散增量和协变判别函数识别蛋白质亚核定位

• 作者: 李凤敏 李前忠 林昊
• 来源期刊: 内蒙古大学学报(自然科学版)
• 学科: 生物学
• 关键词: 离散增量 协变判别函数 亚核蛋白 Jackknife检验
• 年，卷（期）: 2008,（1）
• 页码范围: 56-60
• 页数: 5页
• 分类号: Q61
• 字数: 3434字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-1638.2008.01.011

摘要

利用离散增量结合协变判别函数,选取氨基酸组份和N端氨基酸二肽组份为信息参数,对蛋白质亚核定位进行预测.在序列相似性小于等于25%时,406个单定位亚核蛋白Jackknife检验总预测成功率为75.9%,相关系数CC为0.644,把多定位亚核蛋白作为独立测试集,92个多定位亚核蛋白总预测成功率为78.3%.在序列相似性小于等于65%时,504个单定位亚核蛋白Jackknife检验总预测成功率为75.6%,相关系数CC为0.643,92个多定位亚核蛋白总预测成功率为80.4%.与 Lei等人利用Lei-SVM方法对该数据库预测结果相比,单定位亚核蛋白总预测成功率比Lei等人高9.1%,CC值比Lei等人高0.124,多定位亚核蛋白总预测成功率比Lei等人高15.2%.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	李前忠	内蒙古大学理工学院物理系	87	366	11.0	15.0
2	林昊	内蒙古大学理工学院物理系	14	79	4.0	8.0
3	李凤敏	内蒙古大学理工学院物理系	12	12	3.0	3.0