基于特征融合和有监督局部保持投影的蛋白质亚核定位

• 作者: 刘树慧 王顺芳
• 来源期刊: 计算机应用与软件
• 学科: 工学
• 关键词: 融合表达 有监督局部保持投影 最近邻分类器 十折交叉验证
• 年，卷（期）: 2017,（2）
• 所属期刊栏目: 算法
• 页码范围: 251-255,279
• 页数: 6页
• 分类号: TP3
• 字数: 4920字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1000-386x.2017.02.045

摘要

传统的蛋白质亚核定位利用单一序列特征表达导致信息不足,且表达与定位孤立导致信息不充分利用,为此利用伪氨基酸组成和位置特异性得分矩阵,收集到氨基酸物理化学特性信息和蛋白质进化信息,从而形成信息丰富的融合表达.在该基础上利用有监督局部保持投影学习数据低维流形,进而得到类间分割、类内保持的低维判别特征.然后依据此数据分布,适用最近邻分类器预测亚核位置.最后在标准数据集上,十折交叉验证的评估结果表明:该方法相较于已有方法在精度上有较大提升.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	刘树慧	云南大学信息学院	1	1	1.0	1.0
2	王顺芳	云南大学信息学院	10	66	6.0	8.0