茶苗嫩根cDNA文库的构建和EST分析

• 作者: 史成颖 宛晓春 张正竹 江昌俊
• 来源期刊: 南京农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: cDNA文库 嫩根 茶树 表达序列标签 测序
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 页码范围: 126-130
• 页数: 5页
• 分类号: S571.1|Q523
• 字数: 4682字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1000-2030.2009.01.024

摘要

以茶苗嫩根为材料,采用SMART技术构建了cDNA文库并对其质量进行了鉴定.结果显示,该文库的重组率为92%,库容量为5×105,平均插人片段长度超过1 kb,是一个较高质最的文库.从文库中随机挑取克隆并从5'端单向测定2 651个克隆,获得2 600个有效的EST(expressed sequence tag) ,序列的平均长度为703 bp,用Phrap软件进行拼接,结果获得404个contigs、610个singlets.通过与NCBI的非冗余核酸数据库进行Blastx比对,初步确定已知功能基因734个,推定功能基因102个,未知功能基因178个.该结果既为进一步分离克降茶树根部功能基因奠定了基础,又为以后的差异杂交获取茶树根部特定代谢途径的酶基因及相关的调控基因提供了平台.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	江昌俊	安徽农业大学农业部茶叶生物化学和生物技术重点开放实验室	104	1931	22.0	40.0
2	宛晓春	安徽农业大学农业部茶叶生物化学和生物技术重点开放实验室	162	3012	29.0	46.0
3	张正竹	安徽农业大学农业部茶叶生物化学和生物技术重点开放实验室	97	1388	22.0	33.0
4	史成颖	安徽农业大学农业部茶叶生物化学和生物技术重点开放实验室	16	206	7.0	14.0