基于结构信息的RNA多序列比对

• 作者: 王正志 赵英杰
• 来源期刊: 生物医学工程研究
• 学科: 医学
• 关键词: 多序列比对 RNA二级结构 配对概率矩阵 结构信息矢量 动态规划
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 所属期刊栏目: 论著
• 页码范围: 1-5
• 页数: 5页
• 分类号: R318
• 字数: 4111字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1672-6278.2009.01.001

摘要

本研究提出了一种考虑了结构信息的同源RNA多序列比对算法,它先利用热力学方法计算出每条序列的配对概率矩阵,得到结构信息,由此构造各条序列的结构信息矢量,结合传统序列比对方法,提出优化目标函数,采用动态规划算法和渐进比对得到最后的多序列比对.试验证实了该方法的有效性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	赵英杰	国防科技大学机电工程与自动化学院	5	6	2.0	2.0
2	王正志	国防科技大学机电工程与自动化学院	85	629	13.0	20.0