剑尾鱼肝脏cDNA文库的构建

• 作者: 刘坡 刘春 吴淑勤 李凯彬 王芳 聂湘平
• 来源期刊: 中国水产科学
• 学科: 生物学
• 关键词: 剑尾鱼 肝脏 cDNA文库
• 年，卷（期）: 2009,（4）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 487-495
• 页数: 9页
• 分类号: Q959
• 字数: 5685字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3321/j.issn:1005-8737.2009.04.003

摘要

以暴露于β-萘黄酮(beta-Naphthoflavone,β-NF)中的剑尾鱼(Xiphophorus helleri)为研究对象,采用SMARTTM(SwitchingMechanism At 5,end of RNA Transcript)技术,成功构建了剑尾鱼肝脏cDNA文库.该文库约含有4.2×107个重组子,重组效率达100%,插入片段多在0.6～2.5 kb之间,平均插入片段长度约1.3 kb,扩增后文库滴度为7.0×109 CFU/mL.随机挑取200个重组子进行测序检验,共得到长度大于500 bp的Expression sequence tag(EST)序列187个,对所测EST序列进行拼接,得到16个重叠群(Contigs),81个单拷贝EST,总计单基因簇97个.结果表明,剑尾鱼肝脏的全长cDNA文库已构建成功,且质量较高,从而为筛选剑尾鱼肝脏的功能基因全长序列奠定了基础.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	吴淑勤	中国水产科学研究院珠江水产研究所	121	1516	22.0	31.0
2	李凯彬	中国水产科学研究院珠江水产研究所	67	669	15.0	21.0
3	聂湘平	暨南大学水生生物研究所	59	1507	22.0	37.0
4	刘春	中国水产科学研究院珠江水产研究所	22	70	6.0	7.0
5	王芳	中国水产科学研究院珠江水产研究所	25	86	6.0	8.0
6	刘坡		1	4	1.0	1.0