O型口蹄疫病毒蛋白酶编码序列及氨基酸序列变化的分析

• 作者: 丛国正 周建华 常惠芸
• 来源期刊: 中国人兽共患病学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 口蹄疫病毒 病毒蛋白酶 突变
• 年，卷（期）: 2009,（7）
• 所属期刊栏目: 实验研究
• 页码范围: 645-649
• 页数: 5页
• 分类号: Q343.1
• 字数: 5319字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1002-2694.2009.07.008

摘要

目的 与方法从GenBank中下载了19株O型口蹄疫病毒的Lab、3C、3D基因,结合本实验室收录的FMDV OA/58 Lab、3C、3D的序列信息,分析比较了三种FMDV蛋白酶(Lpro, 3Cpro, 3Dpol)的编码序列和氨基酸序列.结果 这FMDV具有的蛋白酶的编码序列在突变上没有显著差异(P>0.05),而在氨基酸序列的突变上存在着显著差异(P<0.01).通过多重比较发现Lpro与3Cpro和3Dpol在氨基酸突变上存在差异(P<0.05),而3Cpro和3Dpol之间突变差异不显著.结论 利用Swiss-pdbViewer蛋白质分析软件模拟三种蛋白酶中各个突变热点氨基酸残基的替换,发现突变热点不影响三种蛋白酶的空间结构.这表明病毒基因组在复制过程中的突变只是FMDV变异的原始动力,而FMDV变异的方向性进化动力是感染FMDV的宿主细胞对病毒蛋白酶功能造成的选择压力.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	周建华		9	95	5.0	9.0
2	丛国正		8	90	5.0	8.0
3	常惠芸		13	200	7.0	13.0