鲤鱼三、四核苷酸重复微卫星座位的筛选及特征分析

• 作者: 孙效文 李鸥 梁利群 毛瑞鑫 耿龙武 鲁翠云
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 鲤鱼 微卫星 富集文库 三核苷酸和四核苷酸重复
• 年，卷（期）: 2009,（6）
• 所属期刊栏目: 研究论文
• 页码范围: 979-987
• 页数: 9页
• 分类号: S188
• 字数: 5538字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2009.06.007

摘要

采用磁珠富集法结合放射性同位素杂交法分离出鲤鱼(Cyprinus carpio)三、四核苷酸重复的微卫星阳性克隆1 248个.对其中的384个克隆进行测序分析,共得到微卫星序列325个,其中完美型244个(75.08%),非完美型59个(18.15%),混合型22个(6.77%).依据得到的微卫星序列,用Primer3软件在线设计并合成引物145对,检测结果显示71.43%(80对/112对)的引物在野生个体间表现出多态性,等位基因数在3～12之间,多态信息含量(PIC)在0.2109～0.8607之间,80%(40对/50对)的位点处于高度多态水平(PIC＞0.5).对群体的遗传结构评估结果显示,四核苷酸重复的微卫星标记在黑龙江鲤野生群体表现出的多态性水平(PIC=0.7740)高于三核苷酸重复(PIC=0.5161)和双核苷酸重复(PIC=0.49),适用于群体间遗传差异分析和遗传连锁图谱的构建.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙效文	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	159	3935	35.0	57.0
2	耿龙武	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	58	649	15.0	21.0
4	李鸥	大连水产学院生命科学与技术学院	3	93	3.0	3.0
5	梁利群	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	91	2491	28.0	47.0
6	鲁翠云	中国水产科学研究院黑龙江水产研究所	47	1092	18.0	32.0
9	毛瑞鑫	上海水产大学生命科学与技术学院	1	26	1.0	1.0