O型口蹄疫病毒各编码基因及其产物变异率的分析

• 作者: 丛国正 周建华 常惠芸
• 来源期刊: 华北农学报
• 学科: 生物学
• 关键词: 口蹄疫病毒 相对变异率 方差分析 Duncan法
• 年，卷（期）: 2009,（1）
• 页码范围: 60-63
• 页数: 4页
• 分类号: Q785
• 字数: 3275字
• 语种: 中文

摘要

将从Genbank中提出的20株O型FMDV的全基因组分割成12个编码区域,即Lab、VP4、VP2、VP3、VP1、2A、2B、2C、3A、3B、3C和3D.通过方差分析,12个编码序列的相对变异率之间无差异(P>0.05);而这12种编码序列所对应的氨基酸相对突变率之间差异显著(P<0.01).利用Duncan法对这12种氨基酸序列相对突变率进行多重比较,发现3A蛋白的氨基酸相对突变率比其余11种蛋白的差异都显著(P<0.05);VP2、Lpro的氨基酸相对突变率与VP4、2A、2C、3Cpro、3Dpol之间存在差异(P<0.05);而VP4、2A、2C、3Cpro、3Dpol之间无差异.结果显示,O型FMDV自身RNA的转录和机体对FMDV施加的免疫压力不是造成FMDV变异的主要原因,而各种病毒产物的功能选择压力才是FMDV分子进化的主要原因.