粉尘螨变应原第6组分全长cDNA克隆及生物信息学分析

• 作者: 周鹰 孙炜 崔玉宝 彭江龙 王颖
• 来源期刊: 中国免疫学杂志
• 学科: 医学
• 关键词: 粉尘螨 变应原 克隆 生物信息学
• 年，卷（期）: 2009,（7）
• 所属期刊栏目: 免疫学技术与方法
• 页码范围: 641-646
• 页数: 6页
• 分类号: R384.4|R757.3
• 字数: 4074字
• 语种: 中文

摘要

目的:获得粉尘螨变应原第6组分编码基因并了解其分子特征.方法:根据GeneBank已公布的Der f 6核酸序列设计引物,用RT-PCR扩增获得其编码基因,插入pMD19-T载体进行序列测定和生物信息学分析.结果:获得的Der f 6 cDNA全长为840 bp,与参考序列同源性达96.8%,含1个完整的开放读码框.推测编码蛋白由279个氨基酸组成,信号肽序列位于1～19 aa,亲水性指数为-0.139,跨膜区域位于1～19 aa,二级结构由α-螺旋(7.17%)、延伸主链(36.56%)和无规卷曲(56.27%)组成;亚细胞定位于细胞外,N-端第6位和第11位的亮氨酸有明显的序列核输出信号;可能为糜蛋白酶,具有cAMP和cGMP依赖的蛋白激酶磷酸化位点、蛋白激酶C磷酸化位点、酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点、N端酰基化位点等.结论:获得了Der f 6基因全长,其编码的细胞外疏水性蛋白可能具有糜蛋白酶活性.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	孙炜	盐城卫生职业技术学院病原生物学教研室	27	43	4.0	5.0
2	彭江龙	海南医学院海南省热带病重点实验室	28	93	6.0	8.0
3	崔玉宝	盐城卫生职业技术学院病原生物学教研室	45	110	6.0	9.0
4	周鹰	盐城卫生职业技术学院病原生物学教研室	33	73	4.0	7.0
5	王颖	海南医学院海南省热带病重点实验室	17	33	3.0	5.0