大豆C4H基因克隆及生物信息学分析

• 作者: 刘成 吴蕾 李业成 王婵婵 王安娜 马凤鸣
• 来源期刊: 东北农业大学学报
• 学科: 农学
• 关键词: 大豆 C4H 基因克隆 生物信息学分析
• 年，卷（期）: 2010,（4）
• 所属期刊栏目: 作物科学
• 页码范围: 12-16,后插1
• 分类号: S565.1|Q785
• 字数: 3197字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1005-9369.2010.04.003

摘要

为了从分子水平上揭示大豆C4H的结构特点,并为提高其表达活性提供理论依据,利用RT-PCR技术克隆了大豆C4H基因,并已登录GenBank(登录号为FJ770468),长度为1766 bp,编码区1521 bp,编码一个含有506个氨基酸残基的多肤.生物信息学分析显示,CAH理论PI=5.30,Mw=39.092 ku;C4H是易溶、亲水性较强的蛋白,同时有两个明显的疏水峰,有2个跨膜肽段;通过HNN分析表明,C4H各个氨基酸残基对应的二级结构分别为α螺旋(Alpha helk)(Hh):251,49.60%,β折叠(Extended strand)(Ee):52,10.28%,无规卷曲(Random coil)(Cc):203,40.12%;Geno3d模建预测,C4H蛋白中β折叠区有57个折叠,折叠区间有24个α螺旋,此外还有14个卷曲结构.氨基酸序列和结构分析显示CAH蛋白包含了一个保守区,即P450 domain.利用SignalP分析得到信号肽存在几率、信号肽锚定几率均为0.498,切割位点位于28和29位氨基酸之间.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	马凤鸣	东北农业大学农学院	123	2211	25.0	42.0
2	李业成	东北农业大学农学院	7	139	6.0	7.0
3	刘成	东北农业大学农学院	9	139	6.0	9.0
4	王安娜	东北农业大学农学院	6	132	6.0	6.0
5	王婵婵	东北农业大学农学院	5	106	5.0	5.0
6	吴蕾	东北农业大学农学院	6	132	6.0	6.0