玉米同义密码子偏爱性分析

• 作者: 何瑞 刘汉梅 张怀渝 黄玉碧
• 来源期刊: 农业生物技术学报
• 学科: 农学
• 关键词: 玉米 密码子偏爱性 最优密码子
• 年，卷（期）: 2010,（3）
• 所属期刊栏目: 研究报告
• 页码范围: 456-461
• 分类号: S5
• 字数: 3701字
• 语种: 中文
• DOI: 10.3969/j.issn.1674-7968.2010.03.007

摘要

应用CodonW软件对玉米(Zea mays)基因组中的7 402个蛋白质编码基因序列进行了分析,计算了位于密码子3个位置的G+C含量、有效密码子数、同义密码子的使用频率等,并确定了玉米的最优密码子.结果显示,玉米密码子第3位的G+C含量明显高于第1、2位,表现出对以G或C碱基结尾的密码子发生强烈偏向使用;且确定的27种最优密码子均以G或C碱基结尾.分析结果对指导外源基因进行分子改造,提高其在玉米中的表达效率及完善玉米基因预测软件和程序,提高新基因预测和基因组注释准确性等具有重要意义.

作者信息

序号	姓名	单位	发文数	被引次数	H指数	G指数
1	黄玉碧	四川农业大学玉米所	63	1209	18.0	33.0
5	张怀渝	四川农业大学生命理学院	45	790	16.0	26.0
6	刘汉梅	四川农业大学生命理学院	12	189	8.0	12.0
10	何瑞	四川农业大学生命理学院	4	81	4.0	4.0